醫院污水處理設備的運用原理就是將污水中所含的污染物質分離去除、回收利用或將其轉化為無害物質，使水凈化。
1.化學處理法是利用化學反應的作用分離回收污水中各種污染物質的方法，醫院污水處理設備只要用于處理工業廢水。
2.物理處理法是利用物理作用分離污水中呈懸浮國體狀態污染物質的方法。主要方法有：格柵截留法、沉淀法、氣浮法和過濾法等。
3.生物處理法是利用醫院污水處理設備中的微生物的代謝作用使污水中呈溶解、膠體狀態的有機污染物轉化為穩定的無害物質的方法。主要方法有好氧法和厭氧法兩大類，好氧法廣泛應用于處理城市污水及有機性工業廢水，厭氧法則多用于處理高濃度有機廢水與污水處理過程中產生的污泥。
醫院污水處理設備出現停機的解決辦法
1.一般所用系統停止運行，大部分是因為停電所致。因此在日常開關機時，應檢查一下設備外露電纜是否有破損，或是老化現象，一經發現應當立即通知維修師傅進行處理，避免突然停機現象造成的不必要損失。
2.應先將污水泵和加藥裝置手動關停。如果只有醫院污水處理設備主機停止運行，那就需要到是否是多因電源問題所致，可檢查接醫院污水處理設備主機的電源線，或者電控系統是否短路，但是一般醫院污水處理設備的主機硬件是不易損壞的。
3.為了避免醫院污水處理設備出現以上停機問題，同時延長其使用壽命，就需要在當醫院污水處理設備使用完后，及時的對其做維護保養工作。
